Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARPC5O15511 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARPC5O15511 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms