Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3AO14802 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms