Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms