Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HNRNPCL3B7ZW38 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms