Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPBD1B2RD01 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms