Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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