Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms