Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
WIPF3A6NGB9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms