Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms