Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TARSL2A2RTX5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TARSL2A2RTX5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms