Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U3KQV3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U3KQV3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQV3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQV3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQV3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQV3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQV3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQV3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQV3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U3KQV3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQV3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQV3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQV3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQV3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U3KQV3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQV3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQV3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQV3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQV3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQV3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQV3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQV3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U3KQV3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQV3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQV3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQV3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQV3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQV3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U3KQV3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U3KQV3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQV3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U3KQV3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U3KQV3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U3KQV3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U3KQV3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQV3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQV3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQV3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQV3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQV3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQV3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQV3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U3KQV3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQV3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQV3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQV3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQV3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQV3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQV3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQV3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQV3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U3KQV3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQV3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U3KQV3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U3KQV3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQV3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQV3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQV3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQV3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQV3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQV3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U3KQV3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U3KQV3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms