Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X4

FAM169A, Soluble lamin-associated protein of 75 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM169AQ9Y6X4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM169AQ9Y6X4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM169AQ9Y6X4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM169AQ9Y6X4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM169AQ9Y6X4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms