Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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