Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIC4Q9Y696 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIC4Q9Y696 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms