Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF2Q9Y5W3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF2Q9Y5W3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms