Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GTF3C3Q9Y5Q9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GTF3C3Q9Y5Q9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF3C3Q9Y5Q9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms