Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN16Q9Y5I7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms