Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4S1Q9Y587 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms