Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRXN3Q9Y4C0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NRXN3Q9Y4C0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NRXN3Q9Y4C0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NRXN3Q9Y4C0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NRXN3Q9Y4C0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NRXN3Q9Y4C0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NRXN3Q9Y4C0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NRXN3Q9Y4C0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NRXN3Q9Y4C0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NRXN3Q9Y4C0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms