Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTCL1Q9Y4B5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTCL1Q9Y4B5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTCL1Q9Y4B5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms