Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms