Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIP1Q9Y3R0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIP1Q9Y3R0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIP1Q9Y3R0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms