Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED7Q9Y3B3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED7Q9Y3B3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms