Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
COG6Q9Y2V7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
COG6Q9Y2V7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
COG6Q9Y2V7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG6Q9Y2V7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG6Q9Y2V7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
COG6Q9Y2V7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG6Q9Y2V7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
COG6Q9Y2V7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG6Q9Y2V7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
COG6Q9Y2V7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
COG6Q9Y2V7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
COG6Q9Y2V7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms