Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSUH2Q9Y2M2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSUH2Q9Y2M2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSUH2Q9Y2M2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSUH2Q9Y2M2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSUH2Q9Y2M2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSUH2Q9Y2M2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SSUH2Q9Y2M2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSUH2Q9Y2M2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSUH2Q9Y2M2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSUH2Q9Y2M2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms