Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IGSF9BQ9UPX0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF9BQ9UPX0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms