Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAF8Q9UPN6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF8Q9UPN6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF8Q9UPN6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms