Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CIZ1Q9ULV3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CIZ1Q9ULV3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms