Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN2Q9ULH4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRFN2Q9ULH4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRFN2Q9ULH4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms