Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DENND2AQ9ULE3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms