Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC2LQ9UL33 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms