Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP45Q9UL16 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CFAP45Q9UL16 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms