Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP8AP2Q9UKL3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP8AP2Q9UKL3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP8AP2Q9UKL3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms