Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GGA1Q9UJY5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GGA1Q9UJY5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGA1Q9UJY5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GGA1Q9UJY5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GGA1Q9UJY5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GGA1Q9UJY5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GGA1Q9UJY5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms