Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCTN4Q9UJW0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCTN4Q9UJW0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCTN4Q9UJW0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms