Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTRF1LQ9UGC7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRF1LQ9UGC7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms