Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM10Q9UDY6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM10Q9UDY6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms