Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNAL1Q9UBT7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTNNAL1Q9UBT7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms