Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYO1AQ9UBC5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYO1AQ9UBC5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1AQ9UBC5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms