Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RRBP1Q9P2E9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRBP1Q9P2E9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RRBP1Q9P2E9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RRBP1Q9P2E9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms