Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTN3Q9P232 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN3Q9P232 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms