Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXXC1Q9P0U4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CXXC1Q9P0U4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms