Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SENP1Q9P0U3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP1Q9P0U3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms