Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD4Q9NZQ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD4Q9NZQ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD4Q9NZQ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms