Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM53CQ9NYF3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms