Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6AQ9NYA3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6AQ9NYA3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms