Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDND1Q9NY35 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDND1Q9NY35 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms