Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A1Q9NY26 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A1Q9NY26 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms