Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIN1Q9NXP7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms