Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THUMPD1Q9NXG2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms